BigWig là một định dạng tệp để hiển thị dữ liệu dày đặc, liên tục trong bản nhạc trình duyệt bộ gen, được tạo bằng cách chuyển đổi từ định dạng Wiggle (WIG). Định dạng BigWig được mô tả tại trang web Tin sinh học Bộ gen của UCSC và hướng dẫn định dạng tệp của Viện Broad cung cấp thông tin bổ sung.
Định dạng bigWig là gì?
Định dạng bigWig là để hiển thị dữ liệu liên tục, dày đặc sẽ được hiển thị dưới dạng đồ thịCác tệp BigWig được tạo ban đầu từ các tệp loại WIG, sử dụng chương trình UCSC wigToBigWig. Ngoài ra, có thể tạo tệp bigWig từ tệp bedGraph, sử dụng chương trình UCSC bedGraphToBigWig.
Làm cách nào để sử dụng tệp bigWig?
Di chuyển tệp bigWig mới tạo (myBigWig.bw) tới vị trí httpshoặc ftp có thể truy cập web. Dán URL vào biểu mẫu nhập tuyến đường tùy chỉnh hoặc tạo một tuyến đường tùy chỉnh bằng cách sử dụng một đường theo dõi. Dán dòng tùy chỉnh vào hộp văn bản trên trang quản lý tuyến tùy chỉnh.
Đường đua bigWig là gì?
bigWig Tracks là track cho các tín hiệu liên tục trên toàn bộ bộ gen. Chúng thích hợp để hiển thị các kết quả thử nghiệm “thô” khác nhau như tín hiệu ChIP-Seq, tín hiệu RNA-Seq, v.v.
Làm cách nào để tạo tệp bigWig?
Có nhiều cách để tạo tệp bigwig. Điều này thường liên quan đến việc chuyển đổi a. tệp bam thành một rãnh lắc (. wig) và sau đó chuyển đổi rãnh lắc thành một bigwig nhị phân (.
