Mô hình tương đồng thu được cấu trúc ba chiều của protein đích dựa trên sự giống nhau giữa chuỗi mẫu và trình tự đíchvà kỹ thuật này chứng tỏ là hiệu quả khi nghiên cứu các protein màng mà khó kết tinh như GPCR vì nó cung cấp mức độ hiểu biết cao hơn về…
Mô hình tương đồng là gì và tại sao nó lại cần thiết?
1.2.
Mô hình đồng nhất là phương pháp tính toán chính xác nhất để tạo ra các mô hình cấu trúc đáng tin cậyvà được sử dụng phổ biến trong nhiều ứng dụng sinh học. Mô hình đồng nhất dự đoán cấu trúc 3D của một protein truy vấn thông qua sự liên kết trình tự của các protein khuôn mẫu.
Nguyên tắc của Mô hình hóa tương đồng là gì?
Mô hình tương đồng còn được gọi là mô hình so sánh dự đoán cấu trúc protein dựa trên tương đồng trình tự với các cấu trúc đã biết. Nó dựa trên nguyên tắc “ nếu hai protein có độ giống nhau về trình tự đủ cao, chúng có khả năng có cấu trúc ba chiều rất giống nhau.”
Điều gì tạo nên một Mô hình tương đồng tốt?
Nếu chúng ta xác định "mô hình tương đồng thành công cao" là mô hình có <=2 Å rmsd từ cấu trúc thực nghiệm, thì mẫu phải có >=60% đồng nhất trình tự với mục tiêu để thành công tỷ lệ >70%Ngay cả ở mức nhận dạng trình tự cao (60% -95%), vẫn có một trong mười mô hình tương đồng có rmsd >5 Å so với
Điều nào sau đây là đúng về Lập mô hình tương đồng?
Giải thích: Đúng như tên gọi, mô hình tương đồng dự đoán cấu trúc protein dựa trên sự tương đồng trình tự với các cấu trúc đã biếtMô hình tương đồng tạo ra mô hình toàn nguyên tử dựa trên sự liên kết với protein khuôn mẫu.… Không thể sửa lỗi trong bước căn chỉnh trong các bước lập mô hình sau.
