BLAST là một thuật toán máy tínhcó sẵn để sử dụng trực tuyến tại trang web của Trung tâm Thông tin Công nghệ Sinh học Quốc gia (NCBI), cũng như nhiều trang web khác. BLAST có thể nhanh chóng căn chỉnh và so sánh chuỗi DNA truy vấn với cơ sở dữ liệu các trình tự, điều này làm cho nó trở thành một công cụ quan trọng trong nghiên cứu bộ gen đang diễn ra.
BLAST có phải là cơ sở dữ liệu chính không?
BLAST là phần mềm được sử dụng rộng rãi nhất trong nghiên cứu tin sinh học. Chức năng chính của nó là so sánh chuỗi sở thích, chuỗi truy vấn, với chuỗi trong cơ sở dữ liệu lớn BLAST, sau đó báo cáo các kết quả phù hợp nhất, hoặc “số lần truy cập” được tìm thấy trong cơ sở dữ liệu. Chương trình đơn giản này có hai ứng dụng chính.
NCBI có phải là cơ sở dữ liệu không?
NCBI chứa một loạt các cơ sở dữ liệu liên quan đến công nghệ sinh học và y sinh họcvà là nguồn tài nguyên quan trọng cho các công cụ và dịch vụ tin sinh học. Các cơ sở dữ liệu chính bao gồm GenBank cho trình tự DNA và PubMed, một cơ sở dữ liệu thư mục cho tài liệu y sinh. Các cơ sở dữ liệu khác bao gồm cơ sở dữ liệu NCBI Epigenomics.
Có phải BLAST chỉ được sử dụng trong cơ sở dữ liệu NCBI không?
BLAST có sẵn trên web trên trang web NCBI. Các loại BLAST khác nhau có sẵn theo trình tự truy vấn và cơ sở dữ liệu đích.
Cơ sở dữ liệu BLAST hoạt động như thế nào?
BLAST hoạt động như thế nào? BLAST xác định các trình tự tương đồng bằng cách sử dụng phương pháp heuristicmà ban đầu tìm các kết quả trùng khớp ngắn giữa hai trình tự; do đó, phương pháp không tính đến toàn bộ không gian trình tự. Sau trận đấu đầu tiên, BLAST cố gắng bắt đầu căn chỉnh cục bộ từ những trận đấu đầu tiên này.
