Sự mất đi của entropi cấu trúc là đóng góp chính trong nhiệt động lực học của quá trình gấp proteinTuy nhiên, việc xác định chính xác số lượng đã được chứng minh là một thách thức. Chúng tôi tính toán sự mất mát này bằng cách sử dụng mô phỏng động học phân tử của cả protein bản địa và một nhóm trạng thái biến tính thực tế.
Protein entropy cấu trúc là gì?
Entropy phù hợp là entropy liên kết với số lượng các cấu trúc của một phân tử. … Trong protein, góc nhị diện xương sống và rôto chuỗi bên thường được sử dụng làm thông số, và trong RNA, kiểu ghép nối cơ sở có thể được sử dụng.
Cái nào có entropy cấu trúc lớn hơn là một protein gấp lại hoặc một loại chưa mở ra?
Entropy cấu trúc của chuỗi polypeptit lớn hơn đối với trạng thái chưa mở ra so với trạng thái gấp gọn hơn được đặc trưng bởi không gian cấu trúc bị hạn chế hơn nhiều. Do đó, đóng góp này ổn định trạng thái mở (ΔSconf> 0).
Điều gì quyết định sự hình thành protein và vấn đề liên quan đến quá trình gấp protein là gì?
Cấu trúc cơ bản của protein, trình tự axit amin tuyến tính, xác định cấu trúc ban đầu của nó. Các gốc axit amin cụ thể và vị trí của chúng trong chuỗi polypeptit là những yếu tố quyết định các phần của protein xếp gần nhau và hình thành cấu trúc ba chiều của nó.
Những yếu tố nào ảnh hưởng đến sự gấp nếp của protein?
Sự gấp protein là một quá trình rất nhạy cảm bị ảnh hưởng bởi một số yếu tố bên ngoài bao gồm điện trường và từ trường, nhiệt độ, độ pH, hóa chất, giới hạn không gian và sự đông đúc phân tử Những yếu tố này ảnh hưởng đến khả năng Protein gấp lại thành các dạng chức năng chính xác của chúng.
